nanopattern stem cell simulation

Pemberitahuan jadwal sidang sudah diterima tiga hari sebelumnya [1], sedangkan draf diperoleh keesokan harinya [2], keduanya melalui WA. Sampai 07:07 hari ini slide belum diterima. Slide diberikan pada 07:56 [3].

presentation#

Presentasi Tesis 2 dilaksanakan di ruang rapat utama PPNN Gedung CAS Lantai 3 dengan dua pembimbing dan dua penguji, yang semuanya merupakan anggota PPNN.

Gambar 1. Achmad Zacky Fairuza mempresentasikan hasil penelitiannya Simulasi Diferensiasi Sel Punca pada Nanopattern Berdasarkan Fenomena Focal Adhesion.

Situasi ruangan telah memenuhi protokol kesehatan dengan jarak antar pemateri dan para pendengar cukup jauh. Kode yang dibuat sudah cukup baik dengan berbagai pembagian sistemnya yang terstruktur, akan tetapi sayangnya terlalu mengidealkan prosesnya sehingga hasil yang diinginkan belum tercapai.

to-do#

  • Menyelesaikan kode yang dibuat dan menjadikannya sumber terbuka di GitHub sehingga bisa dimanfaatkan oleh yang lain. Mohammad Kemal Agusta telah bersemangat untuk memanfaatkannya sebagai contoh pada perkuliahan MD yang diampunya.
  • Mendapatkan distribusi rapat sel setelah dua sel atau lebih menyatu sehingga diferensiasi, bila tidak bisa secara kuantitatif, setidaknya secara kualitatif dapat menjelaskan pengaruh dari NP pada jenis sel yang dibuat oleh SC. Hal ini ditekankan lagi oleh Suprijadi Haryono.
  • Waktu simulasi yang 2 jam kurang beralasan secara fisis dan seharusnya dikaitkan dengan suatu ukuran waktu pada sel, sebagaimana simulasi MD pada atom, sebagaimana diarahkan oleh MKA.
  • Melakukan variasi lebih banyak NP sehingga efek dari geometeri substrat NP dapat lebih terlihat dalam menentukan bentuk akhir SC.
  • Menjelaskan penyerhanaan yang dilakukan pada model integrin sehingga belalainya tidak disimulasikan akan tetapi dijadikan semacam batang tegak. Hal ini berkonsekuensi pada tidak atau kurang ter-stretch-nya bentuk sel saat dua sel bergabung.
  • Melakukan diskusi rutin untuk menyelesaikan buku tesis agar dapat siap untuk disubmit ke SPS sebelum berangkat ke Osaka.

notes#

  1. Diki, “Undangan Sidang Tesis II”, WhatsApp, 12 Aug 2022 16:05+07, url https://osf.io/t9z7m [2022015].
  2. Achmad Zacky Fairuza, “Simulasi Diferensiasi Sel Punca pada Nanopattern Berdasarkan Fenomena Focal Adhesion”, WhatsApp, 13 Aug 2022 10:41+07, url https://osf.io/72uyg [2022015].
  3. Achmad Zacky Fairuza, “Simulasi Diferensiasi Sel Punca pada Nanopattern Berdasarkan Fenomena Focal Adhesion”, WhatsApp, 15 Aug 2022 07:56+07, url https://osf.io/n47wc [2022015].
    Cite as: viridi, "nanopattern stem cell simulation", bugx, 15 Aug 2022, url https://dudung.github.io/bugx/0149 [20221011].